湖北省建成基于全基因组测序技术的国产食源性疾病分子溯源平台
为推进湖北食品安全领域的信息化建设和大数据应用,澳门金沙娱乐城官网结合湖北省健康大数据信息化平台建设总体要求,不断提升湖北食品安全信息化整体水平,于2021年开始着手建设国产化“基于全基因组测序技术——食源性疾病分子溯源平台”,2023年3月6日正式上线运行。
平台以省、市疾控中心填报监测数据为基础,构建省级大数据中心,包括沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌、单核细胞增生李斯特菌、阪崎克罗诺杆菌、金黄色葡萄球菌和弯曲菌等常见食源性致病菌数据库。
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全基因组测序是一种通过高通量测序技术解析细菌完整基因组序列的方法,能够精确揭示细菌的全部遗传信息。与传统的分子分型技术相比,全基因组测序技术具有更高的分辨率和信息量。这一技术优势使公共卫生专家能够更准确地开展菌株比对分析,有效识别暴发相关菌株,及时追踪食源性疾病暴发事件。通过全基因组测序技术的应用,可显著提升流行病学专家建立食源性疾病与潜在污染食品之间关联的能力,为食品安全风险监测和暴发调查提供了强有力的技术支撑。
平台的建成为我省食源性疾病暴发的病因查明和精准溯源提供了有力的技术支撑,对保障公众身体健康、生命安全,保护食品贸易,维护社会稳定都具有重要的战略意义。
平台具有重要毒力因子、耐药基因、血清分子分型等自动化分析模块,满足基层监测技术机构对测序数据的自动分析,助力基层实验室开展微生物致病和耐药机制及遗传进化等方面的应用基础研究。同时,基于风险监测预警分析引擎,可以实现致病菌监测溯源,通过预警阈值及聚类时间段的设定,实现对海量特征基因数据库实现快速实时比对检索,对相似性菌株进行同源性标记。
目前,该平台已覆盖全省17家市级疾病预防控制中心,在致泻大肠埃希氏菌等致病菌导致的食源性疾病聚集事件调查中发挥着“一锤定音”的关键作用,并且在食品安全风险监测中得到广泛的实际应用。(田峰 詹钰玥)
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